Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CltbQ6IRU5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms