Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt39Q6IFX4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt39Q6IFX4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms