Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Arhgap20Q6IFT4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Arhgap20Q6IFT4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms