Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6GQU0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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