Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lemd2Q6DVA0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lemd2Q6DVA0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lemd2Q6DVA0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lemd2Q6DVA0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lemd2Q6DVA0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lemd2Q6DVA0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms