Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brsk2Q69Z98 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brsk2Q69Z98 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms