Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp4Q68FH0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp4Q68FH0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms