Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BC080695Q66JY9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BC080695Q66JY9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BC080695Q66JY9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms