Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trim24Q64127 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim24Q64127 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms