Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e1Q64104 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e1Q64104 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e1Q64104 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2e1Q64104 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nr2e1Q64104 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nr2e1Q64104 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nr2e1Q64104 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2e1Q64104 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e1Q64104 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms