Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx1Q62443 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nptx1Q62443 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms