Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms