Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl12Q62401 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms