Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trim28Q62318 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim28Q62318 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim28Q62318 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms