Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall3Q62255 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sall3Q62255 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sall3Q62255 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms