Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpcQ62241 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms