Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin1Q61644 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacsin1Q61644 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms