Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fscn1Q61553 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fscn1Q61553 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms