Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EsrrbQ61539 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EsrrbQ61539 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EsrrbQ61539 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms