Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccne1Q61457 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne1Q61457 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccne1Q61457 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms