Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccna1Q61456 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccna1Q61456 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccna1Q61456 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms