Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcanQ61361 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BcanQ61361 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BcanQ61361 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BcanQ61361 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BcanQ61361 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BcanQ61361 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BcanQ61361 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BcanQ61361 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BcanQ61361 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155 ms