Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsg101Q61187 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms