Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxg1Q60987 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms