Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp4Q60972 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp4Q60972 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms