Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

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Length 1,255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tbc1d1Q60949 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d1Q60949 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d1Q60949 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Tbc1d1Q60949 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d1Q60949 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d1Q60949 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d1Q60949 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d1Q60949 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d1Q60949 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d1Q60949 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Tbc1d1Q60949 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Tbc1d1Q60949 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d1Q60949 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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