Protein–RNA interactions for Protein: Q60948

Mxd4, Max dimerization protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd4Q60948 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mxd4Q60948 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mxd4Q60948 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mxd4Q60948 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mxd4Q60948 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxd4Q60948 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mxd4Q60948 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms