Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grik1Q60934 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms