Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r1bQ60829 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms