Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2aQ60648 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2aQ60648 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms