Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema5bQ60519 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema5bQ60519 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms