Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tdrd5Q5VCS6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd5Q5VCS6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms