Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mks1Q5SW45 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms