Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc42Q5SV66 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms