Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctc1Q5SUQ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctc1Q5SUQ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms