Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arhgap44Q5SSM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arhgap44Q5SSM3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap44Q5SSM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms