Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam46cQ5SSF7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam46cQ5SSF7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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