Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps54Q5SPW0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps54Q5SPW0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms