Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rbm27Q5SFM8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm27Q5SFM8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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