Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav2Q5R1I9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav2Q5R1I9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav2Q5R1I9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms