Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv4Q5R1A3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.1 ms