Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf2Q5NC05 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf2Q5NC05 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms