Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grhl3Q5FWH3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grhl3Q5FWH3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grhl3Q5FWH3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms