Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc8bQ5DU41 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8bQ5DU41 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms