Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1lQ5D525 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syce1lQ5D525 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syce1lQ5D525 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms