Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trappc3lQ4KL14 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc3lQ4KL14 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms