Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim9Q3V0X1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim9Q3V0X1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms