Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc114Q3UX62 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc114Q3UX62 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms