Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm12888Q3UW77 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm12888Q3UW77 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm12888Q3UW77 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm12888Q3UW77 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12888Q3UW77 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm12888Q3UW77 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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