Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D130052B06RikQ3UW13 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D130052B06RikQ3UW13 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D130052B06RikQ3UW13 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D130052B06RikQ3UW13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms